大数据分析平台
文章来源:      发布时间:2019-05-07     点击次数:

  高通量测序技术的革命性突破及各类组学技术广泛应用使生命科学快速进入大数据时代,基因组学、转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学、疾病表型组学及特色物种外显子组注释等前沿生物技术的应用,在DNA、RNA、非编码RNA、蛋白质、代谢途径等多维度、多层次被准确检测与分析遗传信息,对生命的认识和思考上升到一个全新的水平,单纯的实验生物学或单层次组学数据分析,都有其片面性与孤立性,很难揭示表型产生的本质机理。面对大规模组学数据,生物学专家与生物信息学专家只有联合起来,才有可能进行有效和正确的解读分析,才有可能做到比较准确的预测和判断,才有可能探知大数据反映的生物学本质,才有可能更有效地指导生物学验证。


        以组学数据为标志的大数据生物信息学,正带动研究人员破解生物的发育特征,发育机制、精准医疗和精准基因修饰育种。草原家畜生物大数据分析平台主要是以实验室生殖调控、遗传繁育和遗传与环境互作三个研究方向的生物学问题为出发点,基于实验室产出的高通量多层次的组学数据,整合来自公共数据平台积累的大量草原家畜相关的基因组遗传信息和高通量组学数据,通过跨学院优势互补的方式整合内蒙古大学丰富的数理统计师资力量,开发优良的算法和工具软件,逐步建立起草原家畜繁殖育种与环境互作信息生物学大数据分析平台(http://bioinfor.imu.edu.cn/public/platform.html)。在国重实验室自主课题的支持下,目前该平台已搭建完成多个生物大数据数据库和在线分析平台:

(1)牛羊早期胚胎发育基因组时序性激活数据库(EmExplorer):http://bioinfor.imu.edu.cn/emexplorer/

(2)蛋白质氨基酸序列约化计算及特征分析平台(RAACBook):http://bioinfor.imu.edu.cn/raacbook/

(3)多组学生物信息可视化分析平台(AutoGene):http://autogene.imu.edu.cn/

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