2018年8月7日，省部共建国家重点实验室邀请同济大学张勇教授来实验室作学术报告，张勇教授首先介绍了课题组在斑马鱼合子基因组激活过程中的研究成果。研究表明，在斑马鱼合子基因组激活之前组蛋白甲基化修饰几乎被完全清除，而DNA甲基化信息则完整的从父本继承下来，这为研究继承下来的DNA甲基化信息对合子基因组激活的影响及机制提供了理想的体内系统。染色质局部开放区域的建立与合子基因转录调控建立密切相关。张勇教授课题组采用ATAC-seq技术，在斑马鱼合子基因组激活前后共5个时间点，分别绘制了全基因组尺度的染色质局部开放区域图谱。通过整合已发表的DNA甲基化及ChIP-seq数据，该工作揭示了斑马鱼合子基因组激活过程中继承的DNA甲基化信息预编程染色质在启动子区域和在远端区域局部两个开放区域建立的不同机制,。这项研究结合表观遗传组学数据产生和生物信息学深度分析，首次在全基因组尺度上揭示了在脊椎动物合子基因组激活过程中，继承的表观遗传信息预编程合子基因组转录调控的机制。
    随后，张勇教授教授了课题组与高绍荣教授课题组合作完成的关于在全基因组水平上揭示了小鼠植入前及植入后胚胎发育过程中异染色质修饰H3K9me3的重编程过程，并阐释了异染色质修饰H3K9me3对于植入前胚胎中逆转座子(Retro-transposons)沉默所起到的重要作用。团队利用ULI-NChIP-seq技术检测了雌雄配子、植入前胚胎发育连续时间点及植入后6.5-8.5天，胚胎发育过程中H3K9me3修饰在全基因组尺度分布水平，对H3K9me3修饰的继承、去除和重新建立进行了详细探讨。该研究首次绘制了早期胚胎发育及植入后胚胎细胞命运决定过程中异染色质修饰H3K9me3的建立图谱，探讨了这种修饰的继承、去除与重建对于细胞获得全能性、维持稳定的基因组结构及确保细胞分化的方向性所起到的作用。这对于人们理解表观遗传学修饰在胚胎发育和细胞分化的过程中的作用提供了有力的证据。本次报告由左永春教授邀请，实验室主任李光鹏教授主持。
    张勇教授。2001年毕业于北京大学地球物理系，获学士学位。2006年毕业于中国科学院生物物理研究所，获得博士学位。2006-2009年，在美国哈佛大学Dana-Farber癌症研究所从事博士后研究。自2009年起被聘为同济大学生命科学与技术学院教授，研究工作针对高通量生物学数据，结合生物信息学方法发展与深度数据分析，研究细胞命运决定过程中的表观遗传信息建立及预编程机制。主要研究成果包括：系统性地开发了表观遗传组数据分析方法及平台，阐释了脊椎动物早期胚胎发育中表观遗传动态变化规律，揭示了胚胎干细胞中表观遗传调控新机制。
    主持多项基金委、科技部项目。在国内外学术期刊上发表论文六十余篇，文章总计被引用超过7500次，其中作为通讯作者在Nature, Nature Cell Biology, Cell Stem Cell, Genome Research等期刊发表论文20余篇。获得国家自然科学基金委优秀青年科学基金项目（2013年）、中组部“青年拔尖人才”（2015年）、中国干细胞学会“干细胞青年研究员奖”（2016年）、上海市优秀学科带头人（2017年）、教育部“青年长江学者”（2018年）等。目前担任Genome Biology期刊编辑委员会成员、中国细胞生物学学会功能基因组学与系统生物学分会委员、中国遗传学会青年委员会委员、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员、中国细胞生物学学会染色质生物学分会委员、中国生物物理学会生物信息学分会委员等。

张勇教授作报告

学术报告现场

供稿：张祥

编辑：张祥